人類の敵ノヴァと戦う人材を教育する機関ゼネティックスに所属するカズヤとサテライザー。2人は力を合わせ幾多の厳しい戦いを切り抜けて行くのであった。パンドラとヴァルキリーの混合部隊である第13小隊配属のため、再び集まった世界ランクのパンドラ達、しかしアラスカ事件で対立してしまったシャルルとサテライザー達は険悪なムードに…一方、エリザベス負傷の原因となったシャルルに対し、アーネット組も動き出し…。