時は西暦2036年。Dr.コッペリウスの行方を追い、東京駅へ辿り着いた荊(いばら)たち。しかしそこには、伊丹刹那(いたみ・せつな)率いる忘れ物係の一団が待ち受けていた……。荊vs.刹那、小津(おづ)姉妹vs.溝口(みぞぐち)兄弟のコッペリオン全面対決は苛烈を極める。果たして荊たちはこの戦いに勝利し、Dr.の破滅的な野望を阻止することができるのか……!?