やさぐれ魔法少女のアカリは、今は亡き先輩魔法少女ユイの息子「明人」を護衛するという依頼を受ける。人間の憎悪、憎愛、欲望から生まれる「邪念」と戦うアカリ。強力な邪念との戦いの日々が続き、アカリの体は徐々に衰弱してゆく。魔法少女の力の源であるエーテルを充電しようとするアカリなのだが…。