時は西暦2036年。原発震災による放射能汚染で完全封鎖された東京。自衛隊の特殊部隊[COPPELION―コッペリオン―]の少女3人は、その死都・東京で懸命の救助活動を続けていた。地獄と化した廃墟を、少女たちは歯をくいしばり前進する。きっと、まだ救える命があるはず……そう信じながら。