巨大な影が月を覆い、ニューメキシコの衛星アンテナが奇妙な音をキャッチした。天才コンピュータ技師デイヴィッドは、宇宙船からの信号は一種のカウントダウンであることを見つける。ホイットモア大統領は全米に緊急避難命令を出すが、宇宙船からの攻撃で都市は壊滅状態になる。7月4日、奇しくも独立記念日に、対エイリアンの秘策と共に人類の命運を賭けた反撃が始まった―。今世紀最高最大映画の原作。